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　　丙酮酸進入線粒體是一種主動運輸方式。由專門的丙酮酸載體運輸（這種載體也可以運送乳酸鹽）。運輸方式是協(xié)同運輸中的反向運輸（antiport)，與線粒體中的氫氧根離子交換。運輸?shù)膭恿κ蔷€粒體內(nèi)膜兩側(cè)的pH差（ΔpH）。ΔpH是電子傳遞過程中氫離子跨膜運輸形成的，消耗了細(xì)胞代謝能量，所以是主動運輸。

　　丙酮酸是利用氫離子協(xié)同運輸?shù)模€粒體內(nèi)膜的這個載體是一種特殊的順氫離子濃度的質(zhì)子泵，它把所釋放的能量與ATP合成偶聯(lián)起來，將氫離子、ATP、丙酮酸等送過膜去。

　　線粒體的外膜（outmembrane）含40%的脂類和60%的蛋白質(zhì)，具有孔蛋白（porin）構(gòu)成的親水通道，允許分子量為5KD以下的分子通過，1KD以下的分子可自由通過。丙酮酸的相對分子質(zhì)量只有90D，能夠自由通過線粒體外膜。

　　協(xié)同運輸（cotransport）是一類靠間接提供能量完成的主動運輸方式。物質(zhì)跨膜運動所需要的能量來自膜兩側(cè)離子的電化學(xué)濃度梯度，而維持這種電化學(xué)勢的是鈉鉀泵或質(zhì)子泵。

　　線粒體的內(nèi)膜（innermembrane）含100種以上的多肽，蛋白質(zhì)和脂類的比例高于3：1。線粒體內(nèi)膜通透性很低，僅允許不帶電荷的小分子物質(zhì)通過，大分子和離子通過內(nèi)膜時需要特殊的轉(zhuǎn)運系統(tǒng)。丙酮酸通過線粒體內(nèi)膜是利用H+梯度協(xié)同運輸?shù)摹?/p>