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蒜種貯藏期間的溫度對二次生長有顯著影響，低溫有促進作用，但不同品種對低溫的反應程度有差異。

蔡家坡紅皮蒜對低溫(0-5℃)和冷涼(14-16℃)條件的反應最敏感，外層型和內(nèi)層型二次生長均大幅度增加，其中內(nèi)層型二次生長的增加幅度更大。蒼山大蒜對低溫和冷涼條件的反應次之，外層型和內(nèi)層型二次生長也有較大幅度的增加，其中外層型二次生長的增加幅度較大。改良蒜對低溫和冷涼條件的反應較遲鈍，內(nèi)層型二次生長有所增加，不發(fā)生外層型二次生長的特性仍未改變。

秋播地區(qū)蒜頭收獲后，多在室溫下貯藏，貯藏期間不會遇到容易誘發(fā)二次生長的低溫和冷涼條件。但秋季播種后，從苗期到花芽、鱗芽分化發(fā)育期都會遇到低溫和冷涼條件，所以蒜種即使不進行低溫和冷涼處理，也有發(fā)生二次生長的可能，只是發(fā)生的嚴重程度較進行過低溫和冷涼處理的要輕一些。

春播地區(qū)蒜頭收獲后要貯藏到翌年3-4月份播種，為了使蒜頭不致受凍，貯藏場所的最低溫度多控制在0℃左右，在長達7-8個月的貯藏期間以及早春露地播種后的一段時間，都具備誘發(fā)二次生長的低溫和冷涼條件。

蒜種貯藏場所除溫度對二次生長有影響外，空氣相對濕度也有影響，而且溫度與空氣相對濕度之間有互作關(guān)系。據(jù)程智慧等報道，蒼山大蒜于播種前30天在5℃和75%-100%空氣相對濕度下貯藏的蒜種，秋播后，翌年外層型二次生長指數(shù)比在5℃和25%-50%空氣相對濕度下貯藏的蒜種增加33倍；內(nèi)層型二次生長指數(shù)增加19倍。而在15℃和25℃下貯藏的蒜種，不同空氣相對濕度(25%-100%)間，無論是外層型二次生長還是內(nèi)層型二次生長的發(fā)生程度均無顯著差異。所以，為了減少二次生長的發(fā)生，在蒜種貯藏期間不但要避免低溫，而且要避免75%以上的空氣相對濕度。