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扇貝屬于卵生型貝類，繁殖時通過貝殼的反復(fù)開臺將成熟的精子和卵子排到海水中，卵子在海水中受精、孵化。孵化出的扇貝幼體經(jīng)擔(dān)輪幼體、面盤幼體、殼頂幼體的發(fā)育變態(tài)后，形成為稚貝。多數(shù)扇貝種類為雌雄異體，如櫛孔扇貝、蝦夷扇貝性腺成熟時，雌性性腺為桔紅色，雄性性腺為乳白色或紅黃色。但海灣扇貝卻為雌雄同體，性腺僅局限于腹部，精巢與卵巢則清晰可見。

在我國北方，蝦夷扇貝每年只有一次繁殖期，為3-4月份前后，水溫為5℃-9℃。而其他扇貝每年都有春秋兩次繁殖期。如櫛孔扇貝春天是5-6月份，水溫為14℃-16℃；秋天是9月份，水溫為22℃-21℃。海灣扇貝春天是6-7月份，水溫為20℃-23℃；秋天是9-10月份，水溫為20℃-18℃。華貴櫛孔扇貝春天是5-6月份，水溫20℃-21℃；秋天是lO-II月份，水溫為26℃-22℃。

扇貝卵子受精后，個體發(fā)生過程基本相同。僅以海灣扇貝個體發(fā)育過程為例。扇貝精卵在海水中受精，在水溫20'C-23℃，受精后IO-ZO分鐘出現(xiàn)第一極體。17小時發(fā)育到擔(dān)輪幼體，20小時發(fā)育到D型幼體，即初期面盤幼體，這時卵黃耗盡并開始攝食。在發(fā)育適溫內(nèi)，溫度越高發(fā)育越快。

受精后3天，殼長一般在125微米-130微米，進(jìn)入殼頂期幼體初期。受精后9天，多數(shù)個體殼長185微米，殼高170微米，這時幼體形態(tài)又有變化，胃膨脹，胃彎曲加長，足明顯易見。殼面生長紋增多，雙殼膨起，殼頂形成并已遮住鉸合線。幼體呈卵圓形，鰓原基出現(xiàn)，鰓基部出現(xiàn)棕黑色眼點(diǎn)。從生態(tài)上看，幼體時而浮游、時而匍匐，尋找適宜的附著基，此期稱為殼頂后期。

幼體附著后，面盤很快退化，逐漸長出次生殼，殼表具很細(xì)的放射線，如受外界刺激，仍能切斷足絲用足匍匐遷移。