1、建設(shè)工程施工合同無效結(jié)算工程款的方式是：施工完畢且驗收合格的可以按照合同約定價款或者按照實際結(jié)算，價款差額不予支付;施工完畢驗收不合格但經(jīng)修復(fù)驗收合格的按照上述辦法結(jié)算，經(jīng)修復(fù)驗收不合格的不予支付;尚未施工完畢合同被確認(rèn)無效的應(yīng)當(dāng)停止施工，視已經(jīng)完成的工程量是否合格依據(jù)上述辦法結(jié)算。
2、法律依據(jù)：《民法典》
第七百九十三條 建設(shè)工程施工合同無效，但是建設(shè)工程經(jīng)驗收合格的，可以參照合同關(guān)于工程價款的約定折價補償承包人。建設(shè)工程施工合同無效，且建設(shè)工程經(jīng)驗收不合格的，按照以下情形處理：
(一)修復(fù)后的建設(shè)工程經(jīng)驗收合格的，發(fā)包人可以請求承包人承擔(dān)修復(fù)費用;
(二)修復(fù)后的建設(shè)工程經(jīng)驗收不合格的，承包人無權(quán)請求參照合同關(guān)于工程價款的約定折價補償。
發(fā)包人對因建設(shè)工程不合格造成的損失有過錯的，應(yīng)當(dāng)承擔(dān)相應(yīng)的責(zé)任
