1、兩者發(fā)生的原因不同。無效行政行為發(fā)生的原因是特別嚴重且明顯的瑕疵，而可撤消行政行為發(fā)生的原因是合法要件缺損或行政決定不適當，屬于一般的瑕疵。
2、兩者溯及效力不同。無效行政行為它自始至終不發(fā)生法律效力，因而在理論上不能作合法、有效的推定。而可撤消行政行為雖然通常使行為自始失去法律效力，但根據(jù)公益需要或行政相對人是否存在過錯等情況，撤消有可僅使行政行為自撤消之日起失效。
3、兩者的確認主體不同。無效行政行為確認主體除了有權(quán)國家機關(guān)。予以確認以外，行政相對人及其他利害關(guān)系人也可自行判定并予以抵制（如《中華人民共和國行政處罰法》第49條規(guī)定：行政機關(guān)及其執(zhí)法人員當場收繳罰款的，必須向當事人出具省、自治區(qū)、直轄市財政部門統(tǒng)一制發(fā)的罰款收據(jù)；不出具財政部門統(tǒng)一制發(fā)的罰款收據(jù)的，當事人有權(quán)拒絕繳納罰款。而可撤消行政行為的確認主體只能是有權(quán)的國家機關(guān)（復(fù)議機關(guān)和人民法院），行政相對人自己無撤銷之權(quán)。
4、兩者的訴訟時效不同。如果相對人向法院提出確認無效的請求，不受訴訟時效的限制。
