不會自動取消。在嫌疑人歸案前一般不會因為證據不足撤銷追逃。但如果確有證據能夠證明不是嫌疑人作案，或者證據不足，公安也會撤銷追逃。
一般來說，公安只有確定一個人具有重大作案嫌疑，且該人在逃時才會網上追逃。所以如果被網上追逃，就基本上可以確定為犯罪嫌疑人了，一般來說證據是比較充分的，證據不足的情況不常見，而且證據是否充分一般要等嫌疑人歸案后才能確定。
網上追逃上網程序
1、對符合上網條件的在逃人員,立案單位要詳細填寫《在逃人員信息登記/撤銷表》中“在逃人員信息登記”部分內容。
2、經縣級以上公安機關負責人審批同意并加蓋公章后，連同在逃人員法律文書原件（拘留證或逮捕證）一并交給同級刑偵部門，由刑偵部門將在逃人員信息錄入《全國在逃人員信息系統(tǒng)》進行網上追逃。
3、立案單位在工作中又發(fā)現新信息的，要立即提交刑偵部門進行修改、補充。
網上追逃撤網程序
1、在逃人員被抓獲后,立案地公安機關對抓獲的在逃人員要認真核對，并于押解回立案地之日起48小時內辦理撤銷手續(xù)。
2、撤網時，立案單位要詳細填寫《在逃人員信息登記/撤銷表》中“在逃人員信息撤銷”部分內容。